疫苗对人体来说是一种外来的刺激，接种后绝大多数人获得对传染病的特异免疫力的同时，由于疫苗的生物学特性和机体的个体差异，个别宝宝疫苗接种后，会出现发热、流鼻涕、头疼、腹泻、食欲不振、针眼部红肿、疼痛或出现硬结等炎症反应，这是疫苗的一般反应，这类反应一般不需特殊处理，2-3天可自行恢复，不会引起受种者机体组织器官、功能损害。 但极个别宝宝由于个体差异，如过敏体质者，接种某种或某些疫苗后可能发生如无菌化脓、皮疹、过敏性休克等变态反应，这是异常反应，需要到医院诊治。还有一些不良反应与疫苗本身无关。比如宝宝正处于某种疾病的潜伏期或存在尚未发现的基础疾病，在接种疫苗后巧合发病，称为偶合症。