现在研究发现，肠道菌群平衡对宝宝的免疫功能起到非常关键的作用。如果宝宝体内有一个很健康、正常的肠道菌群，那么这个宝宝本身的抵抗力都会更好一些。因为母乳里面有很多免疫因子，它可以帮助宝宝建立抵抗力。病原微生物进入体内有一个入侵的途径，母乳中含有IgA免疫球蛋白，对宝宝的表面黏膜免疫起到关键作用。坚持母乳喂养，可以提供给宝宝免疫球蛋白等免疫物质，为宝宝体内黏膜表面竖起一道防线，比较容易抵抗外界病原微生物的入侵。
因某些原因不能坚持母乳喂养时，需要给宝宝提供充足的营养支持。营养支持的作用不可忽视，获得充足、均衡营养，才能保证宝宝的免疫系统不断发展、完善。如果宝宝肠道菌群紊乱，容易出现腹泻、胀气等现象，表示消化功能不好，也许是肠道黏膜的屏障不完善造成的，这样的话宝宝就容易受病原体感染，抵抗力也会更低一些。