高血压
　　咖啡中含有咖啡因，它能使部分敏感患者血压升高。
　　肾衰竭
　　肾衰竭患者若有高血钾现象，需配合限钾饮食，而咖啡含钾量较高。
　　消化性溃疡
　　咖啡因刺激胃酸分泌，使消化系统平滑肌血管松弛，加速食物的代谢，从而降低食物的营养价值。
　　糖尿病
　　咖啡因能降低胰脏中胰岛素的分泌，降低葡萄糖的耐受量，增加胰岛素的排泄量，而使血糖上升。
　　失眠
　　长期饮用咖啡会影响镇静作用，增加清醒次数，使睡眠深度变浅。
　 癫痫
　　咖啡因能刺激脑动力中枢，黄口呤会使血管收缩，减少脑部血流量，对癫痫病患者十分不利。
　　心脏病
　　咖啡会增加脂肪及甘油三酯的含量，增加心脏负担及氧气的消耗量。特别是当身体疲倦及吸烟过度时更易引起心脏病。
　　缺铁性贫血
　　咖啡会加速食物的代谢而降低铁的吸收率。
　　肾结石
　　预防草酸钙结石复发，需禁食富含草酸的食物，而咖啡即为含草酸丰富的食物。