导致先兆流产的因素有多种，大致可分为胚胎本身的因素、母体因素、父方精子异常和环境理化因素等，其中孕早期发生的流产主要是由于胚胎本身异常造成，孕中期的流产则会是受母体因素影响多一些。
1、母体因素：
（1）母体严重的全身性疾病，例如全身性感染、慢性心功能不全、高血压以及其他脏器疾病等；
（2）生殖系统疾病，例如子宫机能不全、宫颈肿瘤、子宫肌瘤，还有子宫畸形也是导致流产的原因，如双子宫、残角子宫、纵膈子宫等；
（3）内分泌异常，如黄体功能不足、甲状腺功能低下、糖尿病等；
（4）情感变化，在短期内情绪发生大的波动或过于紧张会干扰体内的激素分泌，也有可能导致流产。
2、胚胎自身因素：在早期流产的原因之中，很大程度是由于胚胎自身的原因造成的，如染色体异常、基因突变等。另外，当胚胎收到理化因素的影响，如环境污染物、苯、砷、铅等重金属离子、农药等化学物质可能会引起胚胎的发育异常从而导致流产。
3、免疫因素：常见有母子血型不合、封闭性抗体产生不足等。
4、父方因素：如母体存在的抗精子抗体或精子质量不佳也可能导致流产。
5、行为因素：早孕阶段过度的性生活可能会影响胚胎的着床，此外遭受外伤，如腹部受到撞击等都有可能导致流产。